Ein Pyjama ist ein Pyjama ist ein Pyjama ist ein Pyjama ... 
Soll der Pyjama ein reines Schlafgewand sein oder etwa auch zum Frühstück getragen werden?
Ich habe da das Bild des zeitunglesenden Herrn im Morgenmantel am Frühstücktisch sitzend im Kopf.
Grundsätzlich würde ich einen Schnitt wählen, der mit möglichst wenigen Nähten auskommt. Es gibt ja auch Pyjamaoberteile, die gar keine Seitennähte haben. Vlieselinen (... sehr schönes Wort. Danke Herr Koffernäher!) würde ich nur Kragen und Knopfleiste.
Hose mit Zwickel? Ich würde eher die Version ohne Zwickel bevorzugen. Die beste Stil-Polizei bist Du ja selbst, wenn Du Dich vor den Spiegel stellst.
Aber das sind eigentlich alles Fragen, in welchem Stil Du den Pyjama nähen möchtest: Sportlich, tradionell, trendy, ...